Управленческие функции Центра сосредоточены в Новосибирской областной клинической больнице. Она является одним из медучреждений, где проводятся операции по пересадке органов и тканей. Больница будет отчитываться перед департаментом здравоохранения администрации Новосибирской области и соответствующей структурой в мэрии Новосибирска о проделанных операциях и работе с официальными базами по забору донорских органов.
Как отметил руководитель областного департамента здравоохранения Владимир Степанов, в задачи Центра также войдет разработка стратегия развития трансплантологии в регионе.