Международный аэропорт Новосибирск (Толмачёво) прошёл сертификацию системы менеджмента качества ISO 9001:2008. Согласно заключению международного сертификационного органа Bureau Veritas Certification, проводившего аудит предприятия в конце октября 2013 года, производственная деятельность аэропорта Толмачёво соответствует требованиям стандартов.
При оценке учитывались такие показатели как: обслуживание пассажиров и багажа; обслуживание почты и груза; оперативное техническое и наземное обслуживание воздушных судов; предоставление аэронавигационной информации; обеспечение авиационной безопасности; аэродромное обеспечение; электросветотехническое обеспечение; поисковое, аварийно-спасательное и противопожарное обеспечение.