Среднесуточная перевозка пассажиров в Новосибирском метрополитене в 2012 году составила 212 тысяч человек, что на 6 % больше, чем в прошлом году. За 9 месяцев 2012 года услугами метро воспользовались 58 миллионов 87 тысяч человек. При этом максимальное количество пассажиров за день составило 284,2 тысячи.
По данным сайта метрополитена, больше всего пассажиров собирает станция «Площадь Маркса» — 41,5 тысячи человек в сутки, а меньше всего — 8,2 тысячи человек — пользуется станцией «Березовая роща» (в прошлом году — станцией «Маршала Покрышкина»). На станции «Золотая Нива» пассажиропоток за последний квартал вырос на 14 %.
Новосибирский метрополитен находится на 3-м месте среди метрополитенов России по количеству станций, эксплуатационной длине и количеству пассажиров.