Исполнение бюджета области по доходам составило 64 952 миллиона рублей или 100,6% от годовых плановых назначений последней редакции закона. Исполнение расходной части бюджета-2009 составило 67 088 миллионов рублей, то есть 93,8% к плану. Однако, как отметил министр финансов и налоговой политики НСО Леонид Горнин, итоговый бюджетный дефицит в объеме 2 136 миллионов рублей оказался меньше планового на 4 915 миллионов за счет перевыполнения плана по доходам на 382,9 миллиона рублей и неполного исполнения плана по расходам – на 4 532 миллиона рублей. При этом в 2009 году областным бюджетом выполнены все обязательства перед муниципальными образованиями области.