В настоящее время в Новосибирске имеется централизованная система водоотведения мощностью 700 тысяч кубических метров в сутки с развитой системой коллекторов протяженностью 1160 км, 47 насосными станциями, очистными сооружениями полной биологической очистки и выпуском очищенных стоков в Обь. В схему подключены также стоки г. Бердска, г. Обь, р. п. Кольцово, с. Барышева и п. Кудряши.
Новая схема водоотведения Новосибирска разработана специалистами ОАО «Сибгипрокоммунводоканал» в соответствии с генеральным планом города. Документ определяет направления развития городской системы водоотведения. Реализация новой схемы предполагает прокладку 560,5 км коллекторов (52 км дублирующих коллекторов, 15,3 км коллекторов глубокого заложения и 40 насосных станций), реконструкцию 39 насосных станций, внедрение новых технологий очистки сточных вод с увеличением производительности до 840 тысяч кубических метров в сутки. Стоимость всех работ – 44,4 млрд рублей. Реализация документа будет проходить в два этапа: первая очередь (стоимость около 25 млрд рублей) рассчитана до 2015 года, вторая – до 2030 года.