Ученые Института автоматики и электрометрии СО РАН создали особую плату, монтируемую в обычный персональный компьютер, способную ускорять просчет задачи в 20 тысяч раз.
Основным элементом платы является кристалл кремния реконфигурируемой логики серии Xilinx. Алгоритм работы платы прописывается при каждой загрузке ПК, он ориентирует вмонтированный сопроцессор на решение конкретной проблемы.
Сейчас плата ускорения используется в проекте Института цитологии и генетики СО РАН по расшифровке генома человека.
«Поиск в геноме последовательностей из восьми нуклеотидов, отвечающих за формирования того или иного признака, на кластере суперкомпьютера занимал 1,5 дня. На обычном компьютере просчет займет 2 недели. Использование графического ускорителя сократит время решения задачи до 9 часов. А с помощью среднего кристалла серии Xilinx поиск будет завершен за 20 минут», — комментирует заведующий лабораторией программных систем машинной графики ИАиЭ Михаил Лаврентьев.
Новосибирские ученые первые в мире применили кристаллы кремния в биоинформатике и рассматривают возможности применения платы ускорения и в других областях.